海洋学术讲座(155) |海洋古菌的系统发育、分类、分布和潜在代谢通路

发布人:曾瑛
活动时间
-

       2019年10月24日上午,我院海洋学术讲座第155期在D406课室举行。应谢伟副教授的邀请,澳大利亚昆士兰大学的研究员Christian Rinke到访我院,并以《Phylogeny, Taxonomy, Distribution, and Metabolic Potential of Marine Archaea(海洋古菌的系统发育、分类、分布和潜在代谢通路)》为题向海洋科学学院师生进行学术报告。报告由吴文学副教授主持,海科院董西洋副教授、赵诏博士等数十名师生参加了此次讲座。

       Christian博士介绍了美丽的澳大利亚及多样的昆士兰,随后,他以经典的“三域学说”拉开报告的序幕。Christian博士着重介绍了他的研究工作,他的工作聚焦海洋中一种不可培养但极其重要的古菌MGII (Marine Group II)。经过采样、数据搜集和筛选,他的团队最终取得270个样品的基因组数据,并且对其进行了系统发育树分析。另外,Christian博士还向我们介绍了以GTDB (Genome Taxonomy Database) 为核心的分类方法,并且比较了GTDB和NCBI (National Center for Biotechnology Information) 的优劣。在MGII的分布上,Christian博士用ANI (Average Nucleotide Identity) 阐述了270个样品在全球的分布和丰度。最后,Christian博士用古菌的基因组重建了代谢通路,以用于预测这类不可培养古菌的功能,包括古菌的可移动性、变形菌视紫红质 (Proteorhodopsin) 和其在海洋氮循环的角色等。

       会后,Christian博士回答了师生们关于分类系统和古菌定量等问题,并与各位师生进行了热烈的交流讨论。

1

Christian Rinke研究员作报告